Segue abaixo as informações para geração da 2° via de boletos.

Em CNPJ do Cedente: o nosso CNPJ( 90804378000130)
Em CNPJ do Sacado: o CNPJ da sua empresa. 
Em SEU NÚMERO/Nº DO DOCUMENTO: Será preenchido como nº da sua nota fiscal seguida do número da parcela,por exemplo: /1, /2, /3, etc...
Os demais campos ficam em branco.

Segue abaixo uma imagem como exemplo.

Fazendo os passos a cima no site no Banco do Brasil você consegue gerar a sua 2° via do boleto. Clique no botão a baixo onde você vai ser redirecionado para o site do Banco do Brasil, para fazer a geração da 2° via do boleto.